建筑公司与违建业主签的房屋承包合同有效吗

以违法建筑为标的的租赁合同，不因标的违法而被一概认定为无效。
现行法律并未规定以违法建筑为标的的租赁合同均无效。《关于审理城镇房屋租赁合同纠纷案件具体应用法律若干问题的解释》中明确规定以未按建设工程规划许可或未按规划许可内容建设的房屋、未经批准或未按批准内容建设的临时建筑、超期的临时建筑为标的的租赁合同无效，但如在一审庭审辩论终结前对许可审批程序予以补救，可认定有效。
因此，对于法律没有对合同效力明确规定的违法建筑租赁合同，合同效力认定应按照《合同法》规定予以认定，依法审查是否具备合同约定的成立及生效要件，是否属于《合同法》第五十二条规定的合同无效情形，综合认定合同效力。