1、管理单位不一样。根据国管与市管就能区分出你的单位是核心国家机关，国企还是地方国家机关和一般性企事业单位了。基本上国家公务员的公积金都是国管，地方省市公务员的公积金是市管，一般的企事业单位的也是市管。国企大多是国管。
2、在公积金购房方面。贷款年限有很大差异。一般贷款年限的计算公式是 房龄+贷款年限小于等于 一个数值。这个数值，国管的要比市管的要大。也就是说，某些老房子，市管公积金贷不出来钱，国管的就可以的。
3、两者主要的区别是公积金是否可以跨地区使用。
国管是公积金可以跨地区使用，如铁道部，是属于铁道部直管的，他们的单位工人的公积金是可以跨地区使用的。但不是企业可以选择国管还是市管的，要根据单位性质。市管的公积金只可以在公积金缴纳地才可以享受公积金。
