1、一是两者
主观故意的内容不同。
贪污罪的主观故意是
非法占有公共财物，不准备归还而
挪用公款罪的主观故意是暂时占有并使用公款，打算以后予以归还。
行为人主观上是否具有非法占有公款的故意和目的是这两个
罪名最重要的区别。而根据相关司法解释，“不归还”既包括主观上不想还，也包括客观上无力退还。如果行为人挪用公款以后由于客观原因缺乏偿还能力，无法归还亦被认定为非法占有公共财物，不准备归还，以贪污罪论处。
2、二是两者的行为方式不同。贪污罪在客观上表现为使用侵吞、
盗窃、骗取等方法将公共财物占为己有，由于行为人往往采取销毁、涂改、
伪造单据、账目等手段，故在现实生活中难以发现公共财物已经被非法侵吞而挪用公款罪的行为表现为擅自决定动用本单位公款，虽然有时也采取一些欺骗手段，但一般不采用侵吞、盗窃、骗取手段。
3、根据《中华人民共和国
刑法》第三百八十二条的规定 贪污罪是指
国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、
窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。受国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体委托管理、经营国有财产的人员，利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有国有财物的，以贪污罪论。
4、根据《中华人民共和国刑法》第三百八十四条的规定 挪用公款罪是指国家工作人员，利用职务上的便利，挪用公款归个人使用，进行非法活动的，或者挪用公款
数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过3个月未还的行为。
