1、主观方面不同
（1）
劫持航空器罪的
犯罪行为人对航空帮上的人员使用
暴力，其目的在于劫持航空器。
（2）
暴力危及飞行安全罪的犯罪
行为人对正在飞行中的航空器上的人员使用暴力，只有危及民用航空器飞行安全的故意，而无劫持航空器的故意和目的。
2、客观方面表现不同
（1）暴力危及飞行安全罪的犯罪行为人是对正在飞行中的航空器上的人员使用暴力，其犯罪行为只能发生在正在飞行中的航空器内，
犯罪对象是航空器上的人员，犯罪手段仅限于暴力。
（2）劫持航空器罪的犯罪行为人是对正在使用中或正在飞行中的航空器本身和机上人员使用暴力、
胁迫或其他方法，其包括正在使用中如停机待用的航空器，犯罪对象包括对航空器本身和机上人员，犯罪手段也不限于暴力。
