伯父正式起诉了检察院，所以问问批捕书错了，如何进行赔偿

可以向其上一级行政机关申请复议,复议不服的可以向人民法院申请行政诉讼.当事人知道具体的行政行为开始计算直接起诉的期限是三个月.
当事人要求行政赔偿的可以在申请复议和诉讼中一并提出,国家以赔偿金的形式进行赔偿,侵犯人身自由的计算的方式是每日按照国家上半年度职工日平均工资计算.

错误被逮捕后进行司法赔偿的程序：
对没有犯罪事实的人错误逮捕的，作出逮捕决定的机关为赔偿义务机关；赔偿请求人向作为赔偿义务机关的人民法院提出赔偿申请，或者依照国家赔偿法第二十四条、第二十五条的规定向人民法院赔偿委员会提出赔偿申请的，收到申请的人民法院根据本规定予以审查立案。
司法赔偿是指司法机关及其工作人员在行使侦查权、检察权、审判权和看守、监狱管理权时违法给无辜公民、法人或者其他组织的生命、健康、自由和财产造成损害的，国家应当承担赔偿责任。
我国司法赔偿的赔偿范围：
1、对没有犯罪事实或者没有事实证明有犯罪重大嫌疑的人错误拘留的;
2、对没有犯罪事实的人错误逮捕的;
3、依照审判监督程序再审改判无罪，原判刑罚已经执行的;
4、刑讯逼供或者以殴打等暴力行为或者唆使他人以殴打等暴力行为造成公民身体伤害或者死亡的;
5、违法使用武器、警械造成公民身体伤害或者死亡的;
6、违法对财产采取查封、扣押、冻结、追缴等措施的;
7、依照审判监督程序再审改判无罪，原判罚金、没收财产已经执行的;
8、人民法院在民事诉讼、行政诉讼过程中，违法采取对妨害诉讼的强制措施、保全措施或者对判决、裁定及其他生效法律文书执行错误，造成损害的。
我国法律和司法解释明确规定属于国家赔偿范围的，才可以申请司法赔偿;超过法律和司法解释规定范围的赔偿申请，人民法院赔偿委员会不予受理。