最高额借款合同的诉讼时效有多长？

保证合同的诉讼时效与保证期间有关系。保证期间在双方当事人未约定的情况下为主债务履行期限届满6个月。在此期间内只有债权人向保证人主张了债权要求承担保证责任的话，则从此时起算诉讼时效，时效按普通诉讼时效计算为2年。

《民法通则》第一百三十五条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为二年，法律另有规定的除外。
第一百三十八条 超过诉讼时效期间，当事人自愿履行的，不受诉讼时效限制。
第一百四十条 诉讼时效因提起诉讼、当事人一方提出要求或者同意履行义务而中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。
《民事诉讼时效的司法解释》第五条　当事人约定同一债务分期履行的，诉讼时效期间从最后一期履行期限届满之日起计算。
根据法律规定，买卖合同的诉讼时效从债务人履行期限届满开始计算，一般为两年。因为你们的货款是分期支付的，所以应当按照09年6月的履行期限届满之日起计算两年，也就是11年6月。
如果你们公司在这期间一直没有向对方公司催收过质保金，除非对方自愿履行，否则这部分债权已经过了2年的诉讼时效，即使诉讼，也不能得到法律的保护。
如果这两件期间你们曾有过催收的事实出现（比如催款单、电话催收记录），诉讼时效可以从这个时间开始重新计算2年。
最高额借款合同的诉讼时效开发票只能证明你们之间有债权债务关系，证明买卖事实的存在，对主张债权没有影响。