达成协议变更抚养权的流程去哪里办理？

必须去法院。离婚以后，民政局归档的离婚协议就生效了。那份才有约束力。
甚至哪怕你们复婚，也不是说原来的离婚协议就自动作废，必须重新再对相关财产做约定。
现在你去法院起诉变更抚养权，法院受理以后通知你前妻到庭，既然双方已经协商好，那么就会走个象征性的调解过程，重新签订变更抚养权的协议。
这个事情走法院，全程花的钱很少的，放心。

这个涉及到抚养权的变更，若双方都同意变更扶养权，双方可以签订一个变更协议，表明变更的事实就行了，达成协议变更抚养权双方签字就有效了，不用到法院起诉变更。若对方不同意，你认为他的抚养不适合孩子的成长，你可以起诉到法院要求变更。变更子女抚养权应有法定理由： 　
（1）与子女共同生活的一方因患严重疾病或因伤残无力继续抚养子女的； 　　
（2）与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响的； 　　
（3）10周岁以上未成年子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力的；
（4）有其他正当理由需要变更的。