开具的增值税普通发票开票金额和入库总金额不符怎么办

开发票金额与实际到账金额不一致时，按实际业务确认入账。
企业发生销售，开具发票，发票金额为收款金额，应借记应收账款。收取款项时贷记应收账款。
业务有多样性，所以常常会导致到账金额与开发票的金额不符，账务处理时需弄清实际情况分别予以入账。以下是常见情况：
1、购买方未付清账款
这种情况下不需要处理，按实际收到的款项入账即可。
2、发生销售折扣和折让
应当按照扣除商业折扣后的金额确定销售商品收入金额，并且应该开具折扣折让负数发票
账务处理时，应予冲减销售收入，同时冲减应收账款。
3、发生退货
退货账务处理同折扣折让。
4、购买方扣各项费用
账务处理时应借记销售费用，贷记应收账款。需要注意的是，如果未取得对方费用发票，则在所得税汇算清缴时予以调增应税所得。