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社会医疗保险报销是在出院或者转院之后报销。住院及特殊病种门诊治疗的结算流程：定点医疗组织于每月10日前，将上月出院患者的花费结算单、住院结算单及有关资料报医疗保险经办组织，医疗保险经办组织审核后，作为每月预拨及年终决算的依据；医疗保险经办组织每月预拨上月的住院及特殊病种门诊治疗的统筹花费；经认定患有特殊疾病的参保人员应到劳动保障部门指定的一家定点医疗组织就医购药，发生的医药花费直接记帐，即时结算。