复议机关确认违法但不撤销是否合法

此种情形被视为合法存在。
在司法实践中，人民法院可能做出以下裁决来确认违法行为的存在，但并不采取撤销该行政行为的措施：
首先，如果行政行为本身依法应予撤销，然而撤销这一行为将会对国家利益和社会公共利益带来严重损害；
其次，即使行政行为在程序上存在轻微违法之处，只要其对原告的权益并未产生实质性的影响，那么也可以不对其进行撤销。

《行政诉讼法》第七十四条
行政行为有下列情形之一的，人民法院判决确认违法，但不撤销行政行为：
(一)行政行为依法应当撤销，但撤销会给国家利益、社会公共利益造成重大损害的;
(二)行政行为程序轻微违法，但对原告权利不产生实际影响的。
行政行为有下列情形之一，不需要撤销或者判决履行的，人民法院判决确认违法：
(一)行为违法，但不具有可撤销内容的;
(二)被告改变原违法行政行为，原告仍要求确认原行为违法的;
(三)被告不履行或者拖延履行法定职责，判决履行没有意义的。