犯罪嫌疑人证据不足怎么办?

1、存疑不起诉。
2、不起诉不等同于无罪。免于起诉（即不起诉）是人民检察院对自己侦查终结的案件或公安机关侦查终结的案件，经审查认为被告人的行为虽已构成犯罪，但依法不需要判处刑罚或应当免除刑罚所做的免予追究刑事责任的处理决定。

《刑事诉讼法》第一百七十七条
犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。