担保合同仲裁约定和主合同不同怎样处理

担保合同仲裁约定和主合同不同时，要依据《中华人民共和国民法典》等相关法律，结合实际情况处理。
担保合同虽是主合同的从合同，但仲裁约定具有独立性。要是担保合同有独立仲裁约定，按照仲裁自愿原则，该约定对担保合同当事人有约束力。涉及担保合同纠纷时，要按担保合同的仲裁约定，提交指定仲裁机构仲裁。
主合同的仲裁约定只适用于主合同当事人间的纠纷。主合同当事人因主合同起争议，要依据主合同的仲裁约定申请仲裁。
要是债权人同时向主债务人和担保人主张权利，因为担保合同和主合同仲裁约定不同，不能把主合同纠纷和担保合同纠纷一起提交同一仲裁机构仲裁。债权人得分别依据主合同和担保合同的仲裁约定，向不同仲裁机构申请仲裁。
若一方当事人向法院起诉，另一方以存在仲裁约定提出管辖异议，法院会审查仲裁约定的效力。若仲裁约定有效，法院会驳回起诉，让当事人向仲裁机构申请仲裁。

案情回顾:

小朱与小许签订主合同，约定发生纠纷提交A仲裁机构仲裁。同时，小胡为小许的债务提供担保，小胡与小朱签订担保合同，约定发生纠纷提交B仲裁机构仲裁。后小许未履行主合同义务，小朱向小许和小胡主张权利，并试图将主合同纠纷和担保合同纠纷一并提交A仲裁机构仲裁，小胡以担保合同有独立仲裁约定为由提出异议。

案情分析:

1、根据法律规定，担保合同虽为从合同，但仲裁约定具有独立性。本案中担保合同有独立仲裁约定，该约定对小朱和小胡具有约束力，涉及担保合同纠纷应按此约定提交B仲裁机构仲裁。
2、主合同仲裁约定仅适用于主合同当事人，小朱与小许因主合同发生争议，应依据主合同约定向A仲裁机构申请仲裁。
3、因担保合同和主合同仲裁约定不同，小朱不能将主合同纠纷和担保合同纠纷一并提交同一仲裁机构仲裁，需分别依据约定向不同仲裁机构申请仲裁。若小朱向法院起诉，小胡以仲裁约定提出管辖异议，法院审查仲裁约定有效后，会驳回起诉，告知其向仲裁机构申请仲裁。