补偿费、工作经费、用地管理费分开立帐、专款专用。各项费用由业主单位根据任务完成情况、工程进度拨付至市高速公路建设指挥部专户，市指挥部再拨付至各县(市、区)指挥部。土地征收补偿安置费用由各县(市、区)指挥部拨付至国土资源部门的“两费”专户，再支付给被征地集体经济组织。房屋拆迁补偿安置费用由各县(市、区)指挥部直接支付给被拆迁户。
征地补偿的标准在制定时应当合法并且合法，一是因为征地补偿的标准涉及到拆迁户的切身利益，如果制定不合理，容易发生征地纠纷，导致政府的相关政策落实不下去，二是由于征地补偿对土地拆迁的硬性指标，部分不愿意拆迁的居民需要进行积极的沟通协商和处理。
