关于股东胜诉利益的归属，在股东代表诉讼中，由于公司利益受到侵害，股东代为提起诉讼，诉权来源于公司，诉讼的目的是为了维护公司的利益，这直接决定了在股东代表诉讼中，诉讼结果应当归于公司。如果股东代表诉讼以调解方式结案，调解的前提和结果也应是公司受益，而不能是被告直接将相关利益支付给给股东。《征求意见稿》规定，股东代表诉讼中，当事人达成调解协议的，应提交股东会或者股东大会通过调解协议的决议。《解释四》虽然没有保留关于调解的规定，但是《征求意见稿》的规定还是有一定参考价值的。
另外，《征求意见稿》第31条和第35条第2款曾规定，对于全资子公司董监高或者他人侵害子公司利益的行为，导致母公司利益受损，母公司股东有权对子公司管理层提起代表诉讼，胜诉利益属于全资子公司。并将双重代表诉讼制度中的母子公司关系仅限制为“全资控制关系”，但最终仍被删除。可见双重代表制度在一定程度上否认了企业的独立性，对子公司的设立及经营直接产生影响，并有滥诉风险。
