民法典医院科室承包合同是否有效

一般是有效的。签订医疗科室承包合同时，当事人有民事行为能力，是真实意思表示，不违反法律强制性规定和公序良俗的，具有法律效力。
    合同存在下列情形的就算违法：
    1、合同内容或情形违反法律法规强制性规定的；
    2、签订合同的主体是无民事行为能力人的；
    3、合同行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益签订的；
    4、违背公序良俗的；
    5、有行为人与相对人以虚假的意思表示订立的等情形的。
    【法律依据】
    《民法典》第一百四十三条，具备下列条件的民事法律行为有效：
    （一）行为人具有相应的民事行为能力；
    （二）意思表示真实；
    （三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。