扣过12分可以考货运资格证吗？

结论：可以。
解析：
可以考。
货运资格证对驾驶证扣分没有特定的要求，获得货运资格证的条件有：
（一）取得相应的机动车驾驶证；
（二）年龄不超过60周岁；
（三）掌握相关道路货物运输法规、机动车维修和货物装载保管基本知识；
（四）经考试合格，取得相应的从业资格证件。
法律依据：
《道路运输从业人员管理规定》第十条
经营性道路货物运输驾驶员应当符合下列条件：
（一）取得相应的机动车驾驶证；
（二）年龄不超过60周岁；
（三）掌握相关道路货物运输法规、机动车维修和货物装载保管基本知识；
（四）经考试合格，取得相应的从业资格证件。