施工合同工程款纠纷适用专属管辖吗

适用。工程款纠纷是建设工程施工合同纠纷中的一种。最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法》若干问题的解释第二十八条规定建设工程施工合同纠纷按照不动产纠纷确定管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》第三十三条规定下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：
(一)因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖;
(二)因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖;
(三)因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。