污染环境罪立案，3吨污染物会如何处理

按照《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）的补充规定》，违反国家规定，排放、倾倒或处置放射性废物、含传染病病原体的废物、有毒物质或其他有害物质，出现“非法排放、倾倒、处置危险废物三吨以上”的情况，就会被立案追诉。
关于污染环境罪，《中华人民共和国刑法》规定，违反国家规定，排放、倾倒或处置放射性废物、含传染病病原体的废物、有毒物质或其他有害物质，严重污染环境的，处三年以下有期徒刑或拘役，可并处或单处罚金；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
要是排放3吨污染物构成污染环境罪，法院量刑时会综合考量多种因素。包括污染物的种类、性质，排放方式，对环境造成的实际损害程度，犯罪人的主观故意程度，以及是否有自首、立功等情节。要是犯罪人积极采取措施减少污染损害、配合调查，有可能从轻处罚。但如果造成特别严重的环境后果，像导致重大生态破坏、多人健康受损等，就可能在三年以上七年以下量刑。
建议相关企业和个人严格遵守环保法规，避免非法排放污染物。一旦涉及污染环境的行为，应主动配合调查，积极采取措施减少损害，争取从轻处理。

案情回顾:

小朱经营一家工厂，为降低成本，他指使员工将生产过程中产生的有毒废物直接倾倒在工厂附近的河流中。经调查，小朱非法排放的危险废物达5吨。环保部门发现后将案件移交公安机关，小朱被依法逮捕。小朱认为自己只是为了工厂运营，并非故意造成污染，不应承担严重责任。

案情分析:

1、根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）的补充规定》，小朱非法排放危险废物5吨，已达到“非法排放、倾倒、处置危险废物三吨以上”的立案追诉标准，应予以立案。
2、依据《中华人民共和国刑法》，小朱违反国家规定排放有毒物质，严重污染环境，构成污染环境罪。法院量刑时会综合考虑污染物种类、排放方式、对环境实际损害程度等因素。若小朱积极采取措施减少污染损害、配合调查，可能从轻处罚；若造成特别严重环境后果，将在三年以上七年以下量刑。