1、
赔偿义务机关不同。
刑事赔偿的赔偿义务机关是行使侦查、检察、审判职权的各级公安机关、国家安全机关、人民检察院、人
民法院、军队保卫部门，以及看守所、监狱管理机关及其工作人员;而
行政赔偿的赔偿义务机关是各级行政机关及其工作人员。
2、
赔偿的范围不同。刑事赔偿范围是基于行使
刑事诉讼法规定的职权而产生的对公民、
法人和其他组织的人身、
财产损害赔偿，如错误的
刑事拘留、错捕、错判、
刑讯逼供或者在
刑事程序中
违法对财产采取查封、扣押、冻结、追缴等措施;而行政赔偿的范围则是基于各类具体
行政行为而产生的人身、财产
损害赔偿责任。
3、赔偿程序不同。刑事赔偿请求人应当先向赔偿义务机关提出赔偿要求，
逾期不予赔偿或赔偿请求人对赔偿数额有异议的，赔偿请求人可自期间届满之日起三十日内向其上一级机关申请复议;行政赔偿请求人应当先向赔偿义务机关提出赔偿要求，也可以在申请行政赔偿复议和提起
行政诉讼时一并提出，但不得经赔偿义务机关处理而直接提
起诉讼。
法律依据：
《中华人民共和国
国家赔偿法》第七条
