公司注册资本变更已登记，请问注册资本变更修改章程吗？

应该是先在章程中规定出资时间，再按章程规定进行增资并履行验资手续。出资时间由自己公司规定，一般可以把时间范围写的长一些，比如：2012年6月30日之前。

根据《公司法》和《公司登记管理条例》的规定，企业增加注册资本和减少注册资本的变更登记时间稍有差异。公司增加注册资本，应当自股款缴足之日起 30 日内申请变更登记；公司减少注册资本的，应当自公告之日起45日后申请变更登记。公司全体股东或者发起人足额缴纳出资和缴纳股款后，公司申请减少注册资本，应当同时办理减少实收资本变更登记。
从您的描述来看，您的公司已经办理了变更登记，可能还需要补办一下修改后的公司章程或者公司章程修正案。因此，您可以根据上述规定，在营业执照上注明的变更登记日期之前的30日或45日内的这段时间来填写出资时间，还要综合考虑验资报告上注明的时间。