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法律分析：
（1）当原告仅凭借条等债权凭证起诉民间借贷案件，而被告否认收到款项时，法院不会仅依据借条判定，而是会结合借贷金额、款项交付、交易习惯等多方面事实和因素综合审查。
（2）在此情况下，原告负有进一步举证的责任，需提供如转账记录、证人证言、聊天记录等能证明款项已交付的证据。
（3）对于借款金额较小且以现金交付符合交易习惯的，若有借条等证据，法院可能支持原告主张；但借款金额较大时，若原告无法证明款项交付，可能面临不利后果。
提醒：
原告在民间借贷纠纷中，要注重收集款项交付的证据，若遇到复杂情况，建议咨询专业人士进一步分析。
（一）原告要重视进一步举证。当被告否认收到款项，原告应主动收集转账记录作为有力证据，若没有转账记录，聊天记录等能反映款项交付情况的材料也可当作证据。
（二）根据借款金额准备证据。若借款金额小，保留借条等证据；若金额大，除借条外要更充分证明款项已交付，如银行流水、第三方支付记录等。
法律依据：
《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第十六条原告仅依据借据、收据、欠条等债权凭证提起民间借贷诉讼，被告抗辩已经偿还借款的，被告应当对其主张提供证据证明。被告提供相应证据证明其主张后，原告仍应就借贷关系的存续承担举证责任。被告抗辩借贷行为尚未实际发生并能作出合理说明的，人民法院应当结合借贷金额、款项交付、当事人的经济能力、当地或者当事人之间的交易方式、交易习惯、当事人财产变动情况以及证人证言等事实和因素，综合判断查证借贷事实是否发生。
1.仅有借条，被告否认收款时，法院会综合审查。原告仅凭债权凭证起诉，被告抗辩未收到钱，法院会结合借贷金额、交付方式、交易习惯等判断借贷事实。
2.原告要进一步证明款项已交付，可提供转账记录、证人证言、聊天记录等。
3.借款金额小，现金交付符合习惯，有借条法院可能支持；金额大，无法证明交付，原告可能担责。原告应收集证据维权。
结论：
仅有借条，被告否认收到款项时，法院会综合审查判断，原告需进一步举证证明款项已交付。
法律解析：
依据法律规定，当原告仅依据借据等债权凭证提起民间借贷诉讼，而被告抗辩未收到款项时，法院会结合借贷金额、款项交付、交易习惯等事实和因素，综合判断查证借贷事实是否发生。若借款金额较小，以现金交付符合交易习惯且有借条等证据，法院可能支持原告主张；但借款金额较大，原告不能证明款项交付的，可能承担不利后果。所以，原告应尽力收集转账记录、证人证言、聊天记录等能证明款项交付的证据，以此维护自身的合法权益。若大家在民间借贷中遇到类似纠纷或有其他法律问题，欢迎向专业法律人士进行咨询。
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