借给他人款，是存款这，他自己支取的，后来他不承认，可以告他不当得利吗？

这种情况告不当得利不太合适，因为借款本身是有基础借贷关系的。你可以收集证据证明借款事实，比如聊天记录、转账记录、取款凭证等。若有这些能证明是借款给他的证据，可直接以民间借贷纠纷去法院起诉他，要求他归还借款。要尽快行动，避免过了诉讼时效。