爸爸不知所踪没法到场，开庭两次也都未到场，有双方户口本可以更改么

可以的，一个人就可以
直系亲属证明
带直系亲属关系户口簿去派出所，他们会复印户籍底档，然后手写上“本页与原件一致”盖派出所章。我是用来出国签证的，签证中心不要这样的形式，于是到公证处做公证报告，带上户口簿和派出所的复印件和身份证即可。公证费80元，需要翻译外文加40元，3个工作日出报告。
通常有两个办法：
1.通过自己或者父、母、妹妹其中一个人的人事档案证明亲属关系。需要复印档案中的相关文件并加盖档案管理单位的印鉴。
2.到派出所开证明(派出所一般不会出具)，派出所查阅户籍底档的相关记录，然后出具证明。