为什么违章深圳限行，在我老家交警大队却查不到违章？

是的，异地违法记录在车辆登记地的网上车管所是查不到的。但您可以到违法地的（某某省交警总队门户网站）查询

限行违章前两次可以申诉免罚，
第三次开始，每次扣三分罚款三百元。深圳条例：
五、非本市核发机动车号牌载客汽车前两次在本通告禁行区域内违反禁行规定的，不予处罚，自第三次违反禁行规定起进行罚款处罚。
六、对非本市核发机动车号牌其他车辆的交通管理措施，仍按原规定执行。
七、本通告自1月15日至7月14日施行。深圳四个区(南山区、福田区、罗湖区、盐田区)及其它区少量热闹区域对外地车限行(限行时间是工作日上下班高峰即7-9点和17:30-19:30)。你可以关注“深圳交警”微信公众号，找到“办理类服务”，再点击-申请通行证(外地车)，填“车架号后四位”就可以申请一天通行限外区域(每月只能申请一次，要提前一天申请)。深圳口岸路段具体路段：
(一)深圳湾口岸：3广深沿江高速、东滨隧道、东滨路、沙河西路。
(二)皇岗口岸：4广深高速、皇岗路(皇岗口岸段)、百合路、同庆路、福田南路(皇岗口岸段)。
(三)福田口岸：4广深高速、桂花路、国花路、裕亨路。
(四)罗湖口岸：29清平高速、玉平大道、泥岗路(红岭立交至洪湖立交段)、洪湖西路、人民公园路、和平路、沿河南路辅道东行方向(人民南路至文锦南路段)。
(五)文锦渡口岸：29清平高速、玉平大道、泥岗路(红岭立交至洪湖立交段)、文锦北路、文锦中路、文锦南路。
(六)沙头角口岸：30惠深沿海高速、4盐排高速、深盐路、沙盐路、沙深路。
(七)深圳机场：4广深高速、15机荷高速、机场南路、领航高架、空港八道。