有结婚证，法院的判决离婚协议书是无效的吗？

如果没有在婚姻登记机关登记的就不存在婚姻关系，当然就不存在什么结婚不结婚的问题，也没有什么离婚和不离婚的问题。但是如果是登记了，但是找不到结婚证了或者结婚证损毁了，可以根据《婚姻登记条例》 第十七条规定 “结婚证、离婚证遗失或者损毁的，当事人可以持户口簿、身份证向原办理婚姻登记的机关或者一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领。婚姻登记机关对当事人的婚姻登记档案进行查证，确认属实的，应当为当事人补发结婚证、离婚证。”
然后你再去和你对象协商离婚协议，协商不成，可以依法提讼。
离婚协议书范本
男方______，__族，___年__月__日生，住______________________ 身份证号码：_______________________联系电话________________
女方______，__族，___年__月__日生，住______________________ 身份证号码：_______________________联系电话________________
男方与女方于____年__月认识，于____年__月__日在_______登记结婚，婚后于_____年__月__日生育一儿子，名________.因性格不合、常年吵架致使夫妻感情破裂，已无和好可能。现经夫妻双方自愿协商达成一致意见，订立离婚协议如下：
一、男女双方自愿离婚。
二、子女抚养、抚养费及探望权：
儿子______由男方抚养，随同男方生活，抚养费(含托养费、教育费、医疗费)由男方全部负责，女方每月支付抚养费_____元，应于每月的___日前将儿子的抚养费交到男方手中或指定的银行帐号：__________________________)。
在不影响孩子学习、生活的情况下，女方可随时探望男抚养的孩子。
三、夫妻共同财产的处理：
女方自愿放弃夫妻共同财产。
四、债务的处理：
双方确认在婚姻关系存续期间向女方父母借钱______元，向男方姐姐借钱_____元，用于购买挖掘机和房屋。鉴于第三条中女方放弃夫妻共同财产，以上债务由男方一人承担。否则，视为本协议第三条无效，女方可以重新分割夫妻共同财产，同事承担共同债务。
五、协议生效时间的约定：____年___月___日
本协议一式三份，自婚姻登记机颁发《离婚证》之日起生效，男、女双方各执一份，婚姻登记机关存档一份。
六、如本协议生效后在执行中发生争议的，双方应协商解决，协商不成，任何一方均可向_____人民。
男方:________签名___________ ______年___月___日。
女方:________签名___________ ______年___月___日。