我二叔现在属于在逃犯，他在监狱中关了两年，在一次保外就医中逃跑了

刑罚执行没有期限，只要罪犯没有死亡，可随时抓捕并执行脱逃前剩余的刑期。
根据刑法第316条规定，犯脱逃罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役。
脱逃前剩余的刑期与脱逃罪所处刑期实行并罚，如脱逃前犯罪被判处5年，执行3年后脱逃，剩余刑期是2年，脱逃罪被判处4年，那么并罚后应判处的刑期在4年到6年之间，根据情节轻重决定。
自首可以从轻或者减轻处罚。其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。
综上，去自首可从轻或减轻处罚，不去自首如果日后被发现仍要受处罚，随时发现随时抓捕并执行。