我家有一块土地，在上面一直种植蔬菜等农作物，现在忽然一个公司过来铲除了上面的植物，并且霸占这块地，说他们有证，土地纠纷一般由哪个部门解决？

《土地管理法》 第十六条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。　　单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；　　个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。　　当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。　　在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。