请问施工合同主体变更这种情况怎么处理？

施工合同主体变更的同时建设工程施工合同也在变更,《招标投标法》禁止对中标合同实质性内容进行变更,应当从合同法并结合建设工程合同履行的特点界定合同实质性内容的含义,区别实质性内容变更与非实质性变更。
在中标合同约定范围内因设计变更、自然条件、工程量、签证与索赔等因素依据中标合同约定对标的、数量、价款、履行期限进行变更,未损害其他未中标人的合法权益和社会公共利益,均属非实质性变更。情势变更下应允许对合同实质性条款进行变更。非强制招标项目一旦自愿采用招标方式订立合同,也不得进行合同实质性内容的变更。

中标后，招标人与中标人已签订了合同，合同已开始履行，现经双方协商一致，乙方(中标人)要变更合同主体，也就是合同主体变为甲和丙，甲是同意的，也就是说合同的主体是可以变更的，但是要经合同另一方的同意。
根据合同法，合同的权利义务是可以概括转让的，也就是合同的主体是可以变更的，但是要经合同另一方的同意。但是由于此合同是经招投标程序确定，也就是合同乙方是经此程序选定，如果合同在履行的过程中变更主体，新的合同主体并没有经过招投标程序，有规避招投标之嫌。并且，施工合同主体变更有违招投标程序的初衷。

合同主体变更，是指合同当事人变更。主体变更是在其他合同内容不变的情况下，仅仅是权利义务的承担人变更，需要各方达成新的协议。主体变更可以是权利主体变更，也可以是义务主体变更，也可以是权利主体和义务主体都进行变更。权利主体如果是债权人，主体变更就等于是债权转让，通知债务人即可。义务主体如果是债务人，主体变更就等于是债务转让，需要经得债权人同意。实践中，很多合同不仅仅是债权债务这么简单，而且绝大部分是双务合同，即互相承担义务的合同，需要各方协商一致方可变更。有些合同是不允许合同主体变更的，比如建设工程施工合同，是在经过招投标、评标、定标后，选定的符合特定条件的主体签订的合同，不能轻易变更，而且这类合同一般对主体有特殊资质等要求。所以，即使属于可以主体变更的合同，为避免纠纷，也为明确变更事项，一般要以书面形式对变更事项加以确认。