如果未明确时间，公司何时开始支付赔偿款？

《合同法》第六十一条　“合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同有关条款或者交易习惯确定。”按照你所说的情况按与发包方协商达成补充协议或协商不成可按交易习惯根据工程的进度情况向发包方催告支付工程款，否则可以采用停工等措施。建设工程中交易习惯是不允许垫资的，在发包方拒绝支付进度款的情况下就是变相的垫资。