我现在有个体工商户营业执照还可以在注册有限公司吗？

可以申请的。　　
1、个体户升级公司，要根据当地政策了，程序是一样的，要先注销个体营业执照，然后再办理公司执照，中间涉及业务衔接问题。　　
2、一般来说都是直接重新登记注册有限公司的，然后原有的个体户执照注销。程序上的话就相反了，要先准备好公司注册的相关资料，包括申请书，任职书，章程等等一堆材料，然后材料齐的情况下在同一时间提交个体户注销申请，注销后马上办理公司登记。　　如果担心业务衔接问题的话，那最好是先登记注册公司营业执照，然后理顺客户关系了，再注销个体营业执照，因为注销个体营业执照是要收缴公章的，而拿到新的营业执照也需要时间，容易对业务造成影响。