我在三甲医院住院花了七千多，在医院用农保报销了两千，去学校用大学生医保报销说有冲突不能报怎么办

建议协商解决，要看是否符合医院报销规定。
医疗保险是为补偿疾病所带来的医疗费用的一种保险。职工因疾病、负伤、生育时，由社会或企业提供必要的医疗服务或物质帮助的社会保险。如中国的公费医疗、劳保医疗。中国职工的医疗费用由国家、单位和个人共同负担，以减轻企业负担，避免浪费。
住院报销——起付标准低，共付段统筹基金比例最高，个人支付比例最低，选点的医保单位级别不同，住院的起付线、统筹基金报销额度、个人支付额度都大不一样。具体以实际医院规定为准。