宅基地翻建后成违章建筑怎么办

若宅基地翻建成违章建筑，处理方式如下：
一是核实认定合法性。
查看行政机关认定程序和适用法律是否正确，对结果有异议，可在规定时间复议或诉讼维权。
二是尝试补办手续。
向乡镇政府、自然资源部门咨询，按当地规定补办公规划许可等手续。
三是应对拆除处罚。
无法补办时，与行政机关沟通争取合理拆除时间和补偿，可自行拆除可回收部分，遇违法强拆可依法索赔。

案情回顾:
小朱的宅基地翻建房屋后，被行政机关认定为违章建筑。小朱认为行政机关认定程序可能不合法、适用法律或许有误，对认定结果存在异议。但行政机关坚持认定其为违章建筑，双方因此产生争议。

案情分析:

1、小朱若对行政机关的认定结果有异议，可在规定时间内申请行政复议或提起行政诉讼，以核实认定的合法性，查看行政机关认定程序是否合法、适用法律是否正确。
2、若经确认认定无误，小朱可根据当地规定，向乡镇政府、自然资源部门等相关部门咨询能否补充办理规划许可等手续，使建筑合法化。
3、若无法补办手续，小朱可能面临拆除等处罚，此时他应积极与行政机关沟通，争取合理的拆除时间和补偿。对于建筑材料等可回收利用部分，小朱可争取自行拆除以减少损失。若行政机关存在违法强拆等行为，小朱可通过法律途径要求赔偿。