哪些情形可以确认犯罪事实已经查清

有以下情形可确认犯罪事实已查清：
一是单一罪行案件，与定罪量刑有关的事实已明确，不影响定罪量刑的事实查不清。
二是数个罪行案件，部分罪行已查清且符合起诉条件，其他罪行查不清，按已查清的罪行起诉，起诉书中按此叙述。
三是虽无法查清作案工具、赃物去向，但其他证据足以给被告人定罪量刑。
四是证人证言、犯罪嫌疑人供述、被害人陈述主要情节一致，个别情节不同不影响定罪。

案情回顾:

小许因涉嫌多起盗窃案被警方调查。在侦查过程中，发现小许有三起盗窃行为，但其中一起盗窃案的作案工具和赃物去向无法查清，另外两起盗窃案的相关证据充分，与定罪量刑有关的事实已经查清。检方在审查时，对于能否以查清的两起盗窃案对小许进行起诉产生了争议。

案情分析:

1、根据相关规定，对于数个罪行的案件，部分罪行已经查清并符合起诉条件，其他罪行无法查清的，应以已经查清的罪行起诉。本案中，小许的另外两起盗窃案事实清楚，证据充分，符合起诉条件，虽有一起案件作案工具和赃物去向不明，但不影响对已查清的两起盗窃案进行起诉。
2、由于符合第二种情形，检方在起诉书中应按已经查清的两起盗窃罪行进行叙述。