司法实践里，碰到主要事实不清、
证据不足的状况，要按不同阶段采取不同措施。
侦查阶段，要是公安机关发现主要事实不清、证据不足，就得接着侦查，通过补充调查、收集
新证据等办法，进一步查明案件事实。要是
犯罪嫌疑人已
被拘留，而
证据不符合
逮捕条件，就应马上释放或
变更强制措施。
审查起诉阶段，检察院觉得主要事实不清、证据不足，能退回公安机关
补充侦查，也能自行侦查。补充侦查最多两次，每次期限一个月。补充侦查后，要是证据还是不足，不符合
起诉条件，检察院就得作出不
起诉决定。
审判阶段，法院审理时发现主要事实不清、证据不足，可建议检察院补充侦查。若检察院不补充侦查，或者补充侦查后仍达不到证据确实、充分的标准，法院应依法作出证据不足、指控的
犯罪不能成立的
无罪判决。
当事人认为案件主要事实不清、证据不足，可通过合法途径维护自身权益。
刑事诉讼中，犯罪嫌疑人、被告人及其
辩护人可提出证据不足的辩护意见；
民事诉讼中，当事人要积极收集对自己有利的证据，反驳对方主张。
案情回顾:小朱因涉嫌
盗窃罪被公安机关
拘留。公安机关在侦查中发现主要事实不清、证据不足，决定继续侦查。在补充调查
收集证据后，案件进入审查起诉阶段，检察院认为证据仍不足，将案件退回公安机关补充侦查。二次补充侦查后，检察院依旧觉得证据无法满足起诉条件，遂作出不起诉决定。小朱认为自己无罪，一直通过合法途径维护自身权益。
案情分析:1、在侦查阶段，公安机关发现主要事实不清、证据不足时继续侦查是符合规定的，若犯罪嫌疑人已被拘留且证据不符合逮捕条件，应立即释放或变更强制措施。
2、审查起诉阶段，检察院认为证据不足可
退回补充侦查或自行侦查，补充侦查以二次为限，每次一个月，若仍证据不足不符合起诉条件，应作出不起诉决定。
3、审判阶段，若法院发现主要事实不清、证据不足可建议检察院补充侦查，若无法达到证据确实、充分标准，应作出无罪判决。
4、当事人认为案件主要事实不清、证据不足，在刑事诉讼中犯罪嫌疑人、被告人及其辩护人可提证据不足辩护意见，民事诉讼中当事人可收集有利证据反驳对方主张。
