发明专利实质审查程序：
(1) 对
发明专利申请进行实质审查后，审查员认为该申请不符合
专利法及其实施细则的有关规定的，应当通知申请人，要求其在指定的期限内陈述意见或者对其申请进行修改；审查员发出通知书(审查意见通知书、分案通知书或提交资料通知书等)
和申请人的答复可能反复多次，直到申请被授予
专利权、被驳回、被撤回或者被视为撤回。
(2) 对经实质审查没有发现驳回理由，或者经申请人陈述意见或修改后消除了原有缺陷的
专利申请，审查员应当发出授予发明专利权的通知书。
(3) 专利申请经申请人陈述意见或者修改后，仍然存在通知书中指出过的属于专利法实施细则第五十三条所列情形的缺陷的，审查员应当予以驳回。
(4) 申请人无正当理由对审查意见通知书、分案通知书或者提交资料通知书等
逾期不答复的，审查员应当发出申请被视为撤回通知书。
法律依据：
《专利法》第三十六条
发明专利的申请人请求实质审查的时候，应当提交在
申请日前与其发明有关的参考资料。发明专利已经在外国提出过申请的，国务院
专利行政部门可以要求申请人在指定期限内提交该国为审查其申请进行检索的资料或者审查结果的资料；无正当理由逾期不提交的，该申请即被视为撤回。
第三十七条
国务院专利行政部门对发明专利申请进行实质审查后，认为不符合本
法规定的，应当通知申请人，要求其在指定的期限内陈述意见，或者对其申请进行修改；无正当理由逾期不答复的，该申请即被视为撤回。
第三十八条
发明专利申请经申请人陈述意见或者进行修改后，国务院专利行政部门仍然认为不符合本法规定的，应当予以驳回。
第三十九条
发明专利申请经实质审查没有发现驳回理由的，由国务院专利行政部门作出授予发明专利权的决定，发给发明专利证书，同时予以登记和公告。发明专利权自公告之日起生效。
