检察院对案件有异议怎么办

1.侦查阶段：检察院若觉得公安机关该立案却不立案，会要求其说明理由，若理由不成立，便通知立案。

2.审查起诉阶段：若认为犯罪事实不清、证据不足，检察院可退回公安机关补充侦查，也能自行侦查。

3.审判阶段：检察院对判决、裁定有异议，认为有错时，地方各级可向上一级法院抗诉；最高检察院和上级检察院对已生效判决、裁定，发现错误有权按程序抗诉。

法律分析：
（1）侦查阶段，检察院具有立案监督权力。当检察院觉得公安机关该立案却不立案，会让其说明理由，若理由不成立，便通知立案，这能保障应受追诉的犯罪行为被依法处理。
（2）审查起诉阶段，若检察院认为案件犯罪事实不清、证据不足，有两种处理方式。退回公安机关补充侦查可借助其侦查力量进一步完善证据；自行侦查则能更直接深入地调查案件。
（3）审判阶段，检察院对法院判决、裁定有异议时会提出抗诉。地方各级检察院对本级一审判决、裁定有错误可向上级法院抗诉；最高检察院和上级检察院对已生效判决和裁定发现错误，可按审判监督程序抗诉，确保司法裁判的公正性和准确性。

提醒：案件不同阶段检察院处理方式有别，当事人应了解自身案件所处阶段及检察院措施，遇复杂法律问题建议咨询以获取针对性分析。

（一）侦查阶段：检察院认为公安机关该立案却不立案，可要求其说明不立案理由，若理由不成立则通知立案。此阶段，公安机关应积极配合说明情况，若理由不充分要及时立案。
（二）审查起诉阶段：若检察院认为犯罪事实不清、证据不足，可退回公安机关补充侦查，也能自行侦查。公安机关应重视补充侦查要求，尽力完善证据。
（三）审判阶段：检察院对法院判决、裁定有异议且认为确有错误，地方各级检察院对本级一审判决、裁定有错误，可向上一级法院抗诉；最高检察院对各级法院、上级检察院对下级法院已生效判决和裁定，发现错误有权按审判监督程序抗诉。相关法院要重视抗诉并依法处理。

法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十三条规定，人民检察院认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查的，或者被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查，向人民检察院提出的，人民检察院应当要求公安机关说明不立案的理由。人民检察院认为公安机关不立案理由不能成立的，应当通知公安机关立案，公安机关接到通知后应当立案。