对被告不适格的案件应当裁定驳回起诉还是判决驳回诉讼请求

应当判决驳回诉讼请求。
首先，驳回诉讼请求是指人民法院对立案受理的案件经审理后，发现原告请求保护的实体权利不符合法律规定的条件，因而通过判决对原告的请求不予支持，它要解决的是实体意义上的胜诉权问题。
其次，关于被告，该条仅规定起诉必须有明确的被告。可见，我国民事诉讼法对原、被告主体资格的要求采取了两种不同的标准，原告必须适格，被告仅仅要求明确即可。
最后，原告起诉符合起诉的实质要件，法院不能剥夺原告的起诉权利，至于被告是否适格关系到其诉讼请求能否获得支持，应属于实体上的问题，只有经过审理查明才能确定。
综上，被告主体不适格时，不能类比原告不适格裁定驳回起诉，而应当依法判决驳回原告的诉讼请求。
【法律依据】《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》第七十三条，必须共同进行诉讼的当事人没有参加诉讼的，人民法院应当依照民事诉讼法第一百三十二条的规定，通知其参加；
当事人也可以向人民法院申请追加。人民法院对当事人提出的申请，应当进行审查，申请理由不成立的，裁定驳回；申请理由成立的，书面通知被追加的当事人参加诉讼。