我的公司刚刚注册下来，股东的实际出资比例跟工商注册比例是不一样的那么我该如何跟股东拟定合作协议？

如果自己需要注册公司的话，那么肯定会涉及到注册资本的问题了。自己是属于公司股东，那么肯定是需要出钱的，如果说股东实际出资已经大于了注册资本，该如何处理呢?实际中恰恰相反，通常注册资本大于等于实际出资。注册资本是为设立法人企业在登记管理机构登记的资本总额，应为投资各方交付或认缴的出资额之和。简单的说就是投资者承诺交纳的出资额。实际出资就是股东已经向公司缴纳的出资额。作为一个投资者，通常会让自己的手中保持一定的现金流，这样可以保证自己遇到好的项目可以及时的参与进去，所以很多投资者都选择分期出资。当然，实际出资也是可以大于注册资本的，当实际出资额大于注册资本时可以通过以下方法处理：1、可以通过增资扩股变更工商登记的注册资本信息，重新划分出资额份额比例;2、可以将超出注册资本的部分划为公司向股东借款，通过其他应付款核算。《中华人民共和国公司法》第二十六条有限责任公司的注册资本为在公司登记机关登记的全体股东认缴的出资额。法律、行政法规以及决定对有限责任公司注册资本实缴、注册资本最低限额另有规定的，从其规定。《中华人民共和国公司法》第二十八条股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东以货币出资的，应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户;以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。股东不按照前款规定缴纳出资的，除应当向公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。

对于这个问题，解答如下,股权比例如何确定并无明确规定，要由股东自行协商确定。确定股权比例一般要先确定公司的原股东权益，然后根据原股东权益及增资的金额以确定增资后股东的股权比例。确定原股东权益，可以以公司净资产为准，也可以通过评估确定，具体原股东及增资人协商。比如，假如你们的公司现在的股东权益是300万，现在增资100万，那么你们原来股东的股权比例分别是37.5【3002（300100）】，新股东的股权比例是25【100（300100）】，原来的总的四百万的出资。当然，这种计算只考虑了公司的资产状况，确定股权比例还要考虑其它因素，有公司自身的因素，比如公司的经营状况、技术水平、营销网络、知识产权、发展前景、对资金的需求程度等等，也有社会及经济的因素，比如行业发展情况、经济状况、产业政策等，还有股东自身的因素，比如对公司及行业的认可程度、个人的社会地位及影响力、对公司的影响、股东之间的关系等。因此，可以根据公司的具体情况，由新老股东协商确定公司增资后的股权比例。《中华人民共和国公司法》第四十三条股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。