表妹毕业实习，总公司缴纳社保分公司签合同合法吗

看分公司有无法人资格。公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任

一般还是要在总公司签订的。社会保险在总公司缴纳，劳动合同与总公司签订为宜。而且分公司并没有独立的法人资格，即使分公司依法有资格与劳动者签订劳动合同，由此所产生的责任也应当由总公司承担。