债务人失踪，债权人可以向人民法院起诉，通过人民法院公告送达传票和诉讼材料，自发出公告之日起，经过六十日，即视为送达。
经公告送达后，债务人拒不到庭参加庭审的，人民法院可以缺席判决。当发现债务人失踪的，在起诉前应当做好对债务人财产保全的准备措施，有利于实现债权人的债权。
债务人失踪不出庭应诉的，人民法院可以缺席判决，人民法院会根据庭审时原告提供的证据对事实作出认定，依法作出判决。
缺席判决后，经债权人申请，法院可以采取拍卖债务人房屋或财产的办法为债权人清偿债务。
此外，也可以由债权人向法院申请宣告债务人为失踪人，然后由代管人从失踪人的财产中支付借款。
法律依据：
《民法典》第四十条
自然人下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告该自然人为失踪人。
《民法典》第四十三条
财产代管人应当妥善管理失踪人的财产，维护其财产权益。
失踪人所欠税款、债务和应付的其他费用，由财产代管人从失踪人的财产中支付。财产代管人因故意或者重大过失造成失踪人财产损失的，应当承担赔偿责任。
