1.协议的合法性
目前，司法解释认可了一般情况下代持协议的合法性，但是如果违反了法律的强制性规定，则协议仍将被视作无效。
2.条款约定不明
目标公司的
股权在未来存在多种变化的可能性，代持协议应当预见到这些可能发生的变化，并作出相应的约定。
3.实际
出资人难以确立股东身份的风险
虽然司法解释肯定了
股权代持协议的效力，但是投资权益并不等同于股东权益，投资权益只能向名义股东(代持人)主张，而不能直接向公司主张，存在一定的局限性。实际出资人想从幕后走到台前，成为法律认可的股东，光凭一纸代持协议是不够的。根据司法解释，必须经过公司半数以上股东同意，实际出资人方可向法院请求公司变更股东、签发出资证明书、记载于股东名册、记载于
公司章程并办理公司
登记机关登记。
4.名义股东侵害实际出资人利益的风险
在一般的股权代持关系中，实际出资人在幕后，名义股东则在台前代为行使
股东权利，面对各种诱惑，很可能出现名义股东侵害实际出资人利益的情形。
