朋友说是要去公司里面上班的，被交警查出来说是酒驾的，但是朋友只有前两天喝了一点啤酒的，对酒精测试仪测出的数据有异议的,是否可以拒绝配合调查的呢

不能。酒驾的认定必须是以酒精测试仪的数据为依据，酒驾者对酒精测试仪测出的数据有异议的,以抽血鉴定的数据为依据；醉驾的先以酒精测试仪的数据为初步判断，以抽血鉴定的数据为依据。犯罪嫌疑人经呼气酒精含量检验达到规定的醉酒标准，在抽取血样之前脱逃的，可以以呼气酒精含量检验结果作为认定其醉酒的依据。