(一) 两者责任主体不同。停工留薪是《工伤保险条例》规定的一个概念，责任主体是用人企业，指职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资、薪水、福利、保险等待遇不变，由所在单位按月支付。而误工费是针对侵权人而言的一个概念，属于民事赔偿范围。
(二) 对权利主体的要求不同，误工费要求受害人的收入能力和水平差异较大，而工伤职工在停工留薪期内都可以获得停工留薪工资。
(三) 两者包含的项目不同。误工费包括：工资(包含全日制工作收入和兼职工作收入)、资金、津贴、课酬;而停工留薪工资仅包括停工留薪期间内的工资。
(四) 两者的时间计算方式不同，误工费的时间限制根据实际造成的后果有限定的时间，停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。
