昨天晚上我去我新购买的商品房里面去验收房子的时候，发现房里面的屋顶和墙壁都存在非常严重的瑕疵，如果我要申请维修的话，该去找哪一个部门或者哪一方呢？

首先建议你收集相应的证据,这是维权的第一步,然后就需要你自己选择要么找物业反映该问题,要物业进行修复(物业是入住第一期物业,没有更换的情况下,物业是开放商的代表),你可以直接找开发商要求维修,上述两种方式均可以要求赔偿.如果房子不能居住,可以要求退房,并要求开发商赔偿损失。