首先，明确有管辖权的法院，通常是工程所在的那个地方的法院。
这是诉讼的第一步，为后续的程序奠定基础。
接着，精心准备起诉状。
起诉状中需清晰写明原被告的基本信息，让法院和对方清楚双方的身份。
同时，明确提出诉讼请求，像要求支付工程款或是赔偿损失等具体要求。
并且要详细阐述事实与理由，把工程合同履行过程中出现的纠纷情况详细地说明清楚，让法院能充分了解事情的来龙去脉。
然后，认真收集证据。
比如工程合同，这是最关键的证据，能明确双方的权利和义务。
还有施工过程中的各种文件，像签证单能证明工程的变更情况，工程进度报告能展示工程的进展情况。
以及双方往来的函件，能反映双方的沟通和协商情况，还有付款凭证，能证明款项的支付情况等。
将起诉状和这些证据一并提交给法院，法院受理后会把起诉状副本等法律文书送达给被告。
之后就进入开庭审理阶段，双方在此阶段进行举证、质证、辩论等重要环节，充分展示自己的观点和证据。
最后，法院根据审理的具体情况作出判决。
如果一方对判决不服，在规定的期限内可以提起上诉，继续维护自己的权益。
