工程审计纠纷中，审计的工程审计收费标准如下：

在工程审计纠纷中，审计的工程造价审计收费通常采用基本收费＋追加收费两部分组成，基本收费一般定为建设单位送审总造价的0．1—0．3％左右，追加收费一般定为中价机构审减金额的4—9％左右。在工程审计纠纷中，审计的审计服务费用由建设单位支付，在工程投资中单独列支（国家财务部有相关规定）。在工程审计纠纷中，现在对工程审计收费标准，国家不做硬性规定，只是做指导价，具体价格可以与具体审计部门协商以上就是关于小型水利工程如何审计的相关内容。在进行水利工程审计时需要按照审计程序来完成相应的审计内容；同时审计需要提供基建工程相关资料、送审会计报表和审计资料等资料。正确进行工程审计可以避免工程审计纠纷。