持有C1驾驶证在实习期间驾驶摩托车，

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当然有影响，交通违法以身份证号（也就是机动车驾驶证编号）进行录入，有交通违法未处理不能办理驾驶证相关的业务（包括换领、审验等）。逾期不来接受处理，并且经公告三个月仍不来接受处理的，对扣留的车辆依法处理。
因为你仅持有C1车型的驾驶证，骑摩托车属于准驾车型不符，去处理打处罚单时会有如下处罚：
驾驶与驾驶证载明的准驾车型不相符合的车辆的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，（一次记12分），可以并处十五日以下拘留，拖移机动车(无人替代驾驶时)。
机动车驾驶人在实习期内发生道路交通安全违法行为被记满12分的，注销其实习的准驾车型驾驶资格。
摩托车没注册上牌和买保险处罚参考如下：
1、上道路行驶的机动车未悬挂机动车号牌的，或者故意遮挡、污损、不按规定安装机动车号牌的，（一次记12分），罚款20至200元，公安机关交通管理部门应当扣留机动车。
2、不按规定投保机动车第三者责任强制保险的，由公安机关交通管理部门扣留车辆至依照规定投保后，并处依照规定投保最低责任限额应缴纳的保险费的二倍罚款。