我分别两次闯了红灯，被扣了12分了，是不是要从新考试？

结论：需要重新考试的。
解析：
闯两次红灯达到12分属于累计记分达到满分，公安交管部门将扣留驾驶证，驾驶人要参加道路交通安全法律、 法规学习并接受考试。
法律依据：
《中华人民共和国道路交通安全法》 第二十四条
公安机关交通管理部门对机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的行为，除依法给予行政处罚外，实行累积记分制度。公安机关交通管理部门对累积记分达到规定分值的机动车驾驶人，扣留机动车驾驶证，对其进行道路交通安全法律、法规教育，重新考试；考试合格的，发还其机动车驾驶证。对遵守道路交通安全法律、法规，在一年内无累积记分的机动车驾驶人，可以延长机动车驾驶证的审验期。具体办法由国务院公安部门规定。

闯两次红灯扣12分，驾驶证会被扣留。机动车驾驶人应当在十五日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。机动车驾驶人参加学习后，车辆管理所会在二十日内对其进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试，驾驶人考试通过后，就可以拿回驾照。《机动车驾驶证申领和使用规定》第六十六条 对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，处罚与记分同时执行。机动车驾驶人一次有两个以上违法行为记分的，应当分别计算，累加分值。