一、企业破产清算税款的清偿顺序规定
《破产法》规定破产企业所欠税款，应在非优先清偿的一般债权的第二顺序清偿，即在全部破产财产(指变现和追回、清收所得总和)扣除破产费用等，再扣除按规定清偿应优先受偿的债权和所欠职工第一顺序债权后，再以其余额，与除应记入职工个人账户以外的劳动保险费用在同一顺序受偿。经上述分配后余额不足清偿第二顺序债权的，按比例清偿;只够或者不够第一顺序清偿要求的，所欠税款等第二顺序不再清偿。破产企业所欠附加和基金、滞纳金及罚款，分配时则纳入第三顺序“普通破产债权”受偿，第三清偿顺序无财产可供分配的。则不再清偿。
二、破产清算财产相关税款的处理
(一)破产财产变卖必须缴税
1、管理人在破产清算时的应付税款，除企业破产前欠税外，还包括：
(1)破产财产变价的应交税款;
(2)破产时或有税金，比如履行未完合同产品销售时应交税金、破产期间出租企业整体资产等收到租金时应交税金等。
破产清算中财产变现行为2003年最高法院召开破产工作会议时，专门就此作出说明，明确“破产变现应当缴纳相应税金”。
2、就破产税收实务而言，处置财产缴纳税金似乎成为破产清算的必然选择，因为出售商品、转让不动产以及以破产财产对外租赁，肯定有买受方、受让方和承租人，标的为货物、使用权的，买受、承租人必须取得有效发票才能凭以入账和在税前扣除;标的是不动产的，受让方既要凭有效发票办理过户领证，也要凭有效发票入账和计提折旧、摊销。这样，既然无免税或不应税的相应规定，处置、出租破产财产是依法纳税就成为不可避免的了。
(二)税率适用
1、破产企业处置的应适用增值税的项目，主要是出售存货和设备类固定资产，而且，包括在用低值易耗品和设备在内的各项财产，几乎都属于纳税人已使用过的物品，因此应适用销售自己已使用过的物品的税则进行处理。企业应遵循的法律法规，处《增值税暂行条例》及其《实施细则》外，还有财政部、国家税务总局《关于全国实施增值税转型改革若干问题的通知》(财税[2008]170号)、《财政部、国家税务总局关于部分货物适用增值税低税率和简易办法征收增值税政策的通知》(财税[2009]9号)文件，以及国家税务总局《国家税务总局关于增值税简易征收政策有关管理问题的通知》(国税函[2009]902号，以下简称国税函[2009]90号)文件。
2、根据上述这些文件的规定，破产清算财产税款具体税款应该：
(1)破产企业为一般纳税人的，凡购置时未抵扣进项税额或虽已抵扣但以后因故已作进项税额转出的固定资产，使用后出售时，应按4%征收率减半征收增值税。即应纳税额=含税销售额(拍卖价，下同)÷(1+4%)×4%/2;凡购置时已抵扣进项税额，用过后出售的设备类固定资产，以及出售所有存货，均按照适用税率征收增值税。
(2)破产企业为小规模纳税人的，销售自己使用过的固定资产，按2%征收率征收增值税，应纳税额=含税销售额÷(1+3%)2%(国税函[2009]90号原文如此，作者注)：销售除自己已使用过的固定资产以外的物品，按3%征收率征收增值税，应纳税额=含税销售额÷(1+3%)×3%。
(3)所谓销售自己使用过的固定资产。是指销售纳税人根据财务会计制度已经计提折旧的固定资产。
企业破产清算涉及到的税款处理问题一定要分情况来进行处理，并及时缴纳破产清算中变价财产的税款与税金，并了解所适用的税率来计算税款金额。然后来确定破产清算税款的清偿顺序，该顺序中第一清偿顺序永远是优先清偿人以及企业职工，这时尤为需要注意的。